Benigno Zerafa, né le 25 août 1726 à Rabat (Malte) et mort à La Valette le 20 mars 1804 était un compositeur maltais.
Il étudia d'abord, dès ses 9 ans, avec le maestro di cappella de la cathédrale Saint-Paul de Mdina, Pietro Gristi (1696-1738), puis avec Francesco Feo et Girolamo Abos au Conservatoire dei Poveri di Gesù Cristo à Naples en 1738. De retour à Malte, il fut nommé maestro di cappella à la Cathédrale de Mdina en 1744 (succédant à Carlo Imbert), mais, et selon des sources du temps, dues à son caractère, il démissionna de son poste en 1751. Cependant, l'absence de candidats au poste le conduit à rentrer le 15 avril 1753, jusqu'en 1787, quand il a pris sa retraite à l'institut de Saura. Son poste a été remplacé par son assistant Francesco Azopardi. Il avait été ordonné prêtre le 19 septembre 1750.
En tant que compositeur, quelque 170 œuvres ont été conservées, pour la plupart religieuses et pour beaucoup écrites en style ancien. 83 substantielles compositions sacrées survivent à la Cathédrale de Mdina. On y trouve des Messes, parties de Credo, Psaumes, Graduels, Offertoires, Litanies, Hymnes, Séquences et Antiphones, Motets et Responsories de la Semaine Sainte. En outre, un Requiem à 4 voix et orgue est conservé dans les Archivio Crypta Sancti Pauli (CSP) de Rabat.
Sa dernière composition, Litaniae B. Mariae Virginis, est datée de 1782. Zerafa, qui avait été ordonné prêtre le 19 septembre 1750, était un compositeur doué. 170 de ses œuvres existent (dans la cathédrale de Mdina), toutes sacrées et englobant pratiquement tous les genres contemporains ainsi que le stile antico. Exceptionnellement, il préféra les mises en musique «Kyrie–Gloria–Agnus Dei» de la messe. Il composa plusieurs de ces œuvres avec des structures en plusieurs mouvements, soit pour chœur double soit pour chœur simple à quatre voix, avec accompagnement instrumental. Compositeur de profondeur et d'individualité sensible et techniquement accompli (Heighes), l'économie et l'ascétisme de son style bref créent une aura d'humble dévotion dans sa musique.